Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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