Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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CUL3Q13618 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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CUL3Q13618 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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CUL3Q13618 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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CUL3Q13618 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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