Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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