Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms