Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms