Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMF1P82094 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMF1P82094 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMF1P82094 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMF1P82094 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMF1P82094 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMF1P82094 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMF1P82094 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMF1P82094 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMF1P82094 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMF1P82094 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMF1P82094 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMF1P82094 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMF1P82094 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMF1P82094 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMF1P82094 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TMF1P82094 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TMF1P82094 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMF1P82094 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMF1P82094 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMF1P82094 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMF1P82094 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMF1P82094 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMF1P82094 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMF1P82094 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMF1P82094 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMF1P82094 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMF1P82094 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMF1P82094 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMF1P82094 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMF1P82094 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMF1P82094 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMF1P82094 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMF1P82094 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMF1P82094 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMF1P82094 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMF1P82094 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMF1P82094 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMF1P82094 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMF1P82094 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMF1P82094 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMF1P82094 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMF1P82094 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMF1P82094 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMF1P82094 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMF1P82094 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMF1P82094 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMF1P82094 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMF1P82094 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMF1P82094 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMF1P82094 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMF1P82094 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMF1P82094 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMF1P82094 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMF1P82094 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMF1P82094 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMF1P82094 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMF1P82094 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMF1P82094 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMF1P82094 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMF1P82094 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMF1P82094 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMF1P82094 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMF1P82094 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMF1P82094 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMF1P82094 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMF1P82094 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMF1P82094 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMF1P82094 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMF1P82094 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMF1P82094 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMF1P82094 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMF1P82094 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms