Protein–RNA interactions for Protein: P62834

RAP1A, Ras-related protein Rap-1A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1AP62834 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms