Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

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Length 783 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIK1P57059 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIK1P57059 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIK1P57059 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SIK1P57059 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIK1P57059 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIK1P57059 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIK1P57059 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIK1P57059 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIK1P57059 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIK1P57059 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIK1P57059 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIK1P57059 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SIK1P57059 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIK1P57059 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIK1P57059 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIK1P57059 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIK1P57059 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIK1P57059 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIK1P57059 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIK1P57059 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIK1P57059 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIK1P57059 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIK1P57059 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIK1P57059 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIK1P57059 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIK1P57059 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIK1P57059 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIK1P57059 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIK1P57059 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIK1P57059 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIK1P57059 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIK1P57059 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIK1P57059 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIK1P57059 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIK1P57059 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SIK1P57059 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIK1P57059 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIK1P57059 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIK1P57059 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SIK1P57059 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIK1P57059 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SIK1P57059 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIK1P57059 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIK1P57059 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIK1P57059 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIK1P57059 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIK1P57059 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIK1P57059 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIK1P57059 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIK1P57059 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIK1P57059 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIK1P57059 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIK1P57059 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIK1P57059 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SIK1P57059 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIK1P57059 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIK1P57059 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIK1P57059 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIK1P57059 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIK1P57059 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIK1P57059 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIK1P57059 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SIK1P57059 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIK1P57059 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIK1P57059 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIK1P57059 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIK1P57059 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIK1P57059 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIK1P57059 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SIK1P57059 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIK1P57059 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIK1P57059 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIK1P57059 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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