Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME5P56597 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME5P56597 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME5P56597 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME5P56597 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME5P56597 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME5P56597 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME5P56597 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME5P56597 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME5P56597 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME5P56597 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME5P56597 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME5P56597 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME5P56597 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME5P56597 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME5P56597 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME5P56597 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME5P56597 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME5P56597 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME5P56597 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME5P56597 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME5P56597 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME5P56597 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME5P56597 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms