Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLTPP55058 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLTPP55058 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLTPP55058 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PLTPP55058 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PLTPP55058 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLTPP55058 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLTPP55058 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLTPP55058 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLTPP55058 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PLTPP55058 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLTPP55058 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLTPP55058 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLTPP55058 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLTPP55058 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLTPP55058 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLTPP55058 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLTPP55058 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLTPP55058 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLTPP55058 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLTPP55058 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLTPP55058 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLTPP55058 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLTPP55058 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLTPP55058 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PLTPP55058 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms