Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACLYP53396 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ACLYP53396 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACLYP53396 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACLYP53396 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACLYP53396 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACLYP53396 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ACLYP53396 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACLYP53396 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ACLYP53396 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms