Protein–RNA interactions for Protein: P52803

EFNA5, Ephrin-A5, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA5P52803 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFNA5P52803 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms