Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms