Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms