Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms