Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGB4P16144 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms