Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNNT1P13805 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms