Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms