Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms