Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ3O43525 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms