Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
J3QR89 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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