Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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