Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms