Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms