Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
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