Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZW8

MS4A7, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A7Q9GZW8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MS4A7Q9GZW8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MS4A7Q9GZW8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MS4A7Q9GZW8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MS4A7Q9GZW8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MS4A7Q9GZW8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MS4A7Q9GZW8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MS4A7Q9GZW8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MS4A7Q9GZW8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MS4A7Q9GZW8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A7Q9GZW8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A7Q9GZW8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A7Q9GZW8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A7Q9GZW8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A7Q9GZW8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A7Q9GZW8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A7Q9GZW8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A7Q9GZW8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A7Q9GZW8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms