Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SLC4A5-204ENST00000377634 3814 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms