Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 5314 ntTSL 219.12■□□□□ 0.657e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 WDR43-203ENST00000434238 386 ntTSL 319.08■□□□□ 0.647e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SEPT9-223ENST00000589140 552 ntTSL 419.06■□□□□ 0.647e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 GOLGA4-209ENST00000450863 1617 ntTSL 519.06■□□□□ 0.647e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PRSS53-203ENST00000492427 1782 ntTSL 319.01■□□□□ 0.637e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.637e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.637e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.627e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PDE9A-227ENST00000495521 1565 ntTSL 1 (best)18.93■□□□□ 0.627e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PDE9A-225ENST00000490803 1865 ntTSL 1 (best)18.93■□□□□ 0.627e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.627e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.627e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NUP58-203ENST00000381747 1659 ntTSL 518.87■□□□□ 0.617e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.617e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.617e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.617e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.617e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.67e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 KCTD20-206ENST00000474988 1618 ntTSL 218.78■□□□□ 0.67e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.597e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ILF3-223ENST00000593061 475 ntTSL 318.73■□□□□ 0.597e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CARD10-204ENST00000433485 578 ntTSL 418.72■□□□□ 0.597e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.587e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LMNB1-204ENST00000463908 557 ntTSL 418.63■□□□□ 0.577e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.577e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.572e-15■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TSC2-226ENST00000569930 2621 ntTSL 218.59■□□□□ 0.577e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 COL27A1-205ENST00000485397 463 ntTSL 518.58■□□□□ 0.567e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 HIF1AN-203ENST00000526476 708 ntTSL 318.58■□□□□ 0.567e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.567e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 HDAC10-207ENST00000470378 1034 ntTSL 318.53■□□□□ 0.567e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.557e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.547e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NEIL1-205ENST00000564738 612 ntTSL 318.41■□□□□ 0.547e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CARD10-205ENST00000437756 2140 ntTSL 1 (best)18.41■□□□□ 0.547e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.537e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.527e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 5751 ntTSL 218.3■□□□□ 0.527e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 PDE9A-216ENST00000462571 1784 ntTSL 1 (best)18.27■□□□□ 0.517e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.517e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.517e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SNRNP70-207ENST00000598984 547 ntTSL 518.25■□□□□ 0.517e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.517e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 PROC-202ENST00000402125 779 ntTSL 218.23■□□□□ 0.517e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PDE9A-215ENST00000460989 1521 ntTSL 1 (best)18.22■□□□□ 0.517e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.57e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PDE9A-221ENST00000470987 1954 ntTSL 1 (best)18.19■□□□□ 0.57e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ANKS3-223ENST00000592077 2302 ntTSL 1 (best)18.14■□□□□ 0.497e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.497e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.12■□□□□ 0.497e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.492e-15■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BCAP31-202ENST00000416815 688 ntTSL 518.08■□□□□ 0.487e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.477e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.467e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.467e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.467e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ACSS2-210ENST00000476922 1527 ntTSL 217.89■□□□□ 0.457e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SEMA4B-210ENST00000559300 541 ntTSL 417.84■□□□□ 0.457e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.457e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.452e-15■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.447e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.447e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SEPT9-243ENST00000592407 509 ntTSL 217.78■□□□□ 0.447e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.447e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.437e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 VOPP1-214ENST00000462326 536 ntTSL 417.73■□□□□ 0.437e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KCTD20-205ENST00000460983 597 ntTSL 417.69■□□□□ 0.427e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KCTD20-209ENST00000498267 547 ntTSL 417.69■□□□□ 0.427e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MVK-216ENST00000636996 1725 ntTSL 517.69■□□□□ 0.427e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.427e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ABCD3-204ENST00000468860 661 ntTSL 317.68■□□□□ 0.427e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.427e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BRAT1-206ENST00000493232 5360 ntTSL 217.66■□□□□ 0.427e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.427e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SMAP2-202ENST00000372718 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)17.61■□□□□ 0.417e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-238ENST00000640421 1872 ntTSL 517.59■□□□□ 0.417e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LMNA-211ENST00000470199 551 ntTSL 417.51■□□□□ 0.397e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.397e-6■■■■■ 27.5
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