Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN19Q8N6F1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN19Q8N6F1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN19Q8N6F1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN19Q8N6F1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN19Q8N6F1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN19Q8N6F1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN19Q8N6F1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN19Q8N6F1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN19Q8N6F1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN19Q8N6F1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN19Q8N6F1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN19Q8N6F1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN19Q8N6F1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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