Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms