Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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EXT1Q16394 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EXT1Q16394 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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EXT1Q16394 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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EXT1Q16394 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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EXT1Q16394 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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EXT1Q16394 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EXT1Q16394 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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EXT1Q16394 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXT1Q16394 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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EXT1Q16394 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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EXT1Q16394 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXT1Q16394 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXT1Q16394 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXT1Q16394 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXT1Q16394 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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EXT1Q16394 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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EXT1Q16394 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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EXT1Q16394 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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EXT1Q16394 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXT1Q16394 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXT1Q16394 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXT1Q16394 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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