Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P11Q13670 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms