Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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