Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms