Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms