Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HBBP68871 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HBBP68871 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HBBP68871 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HBBP68871 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HBBP68871 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HBBP68871 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HBBP68871 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HBBP68871 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HBBP68871 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HBBP68871 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
HBBP68871 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms