Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms