Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTTPP55157 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTTPP55157 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTTPP55157 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTTPP55157 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTTPP55157 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTTPP55157 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTTPP55157 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTTPP55157 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTTPP55157 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTTPP55157 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTTPP55157 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTTPP55157 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTTPP55157 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTTPP55157 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MTTPP55157 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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