Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PLNP26678 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PLNP26678 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PLNP26678 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PLNP26678 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms