Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 GIMAP7-201ENST00000313543 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 SPINK1-203ENST00000510027 1188 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 MGST1-204ENST00000396209 979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms