Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf47O95873 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms