Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEBLO76041 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEBLO76041 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NEBLO76041 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEBLO76041 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEBLO76041 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEBLO76041 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEBLO76041 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEBLO76041 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEBLO76041 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEBLO76041 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEBLO76041 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEBLO76041 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEBLO76041 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEBLO76041 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEBLO76041 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEBLO76041 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEBLO76041 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEBLO76041 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEBLO76041 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEBLO76041 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEBLO76041 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEBLO76041 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEBLO76041 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEBLO76041 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEBLO76041 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEBLO76041 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEBLO76041 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms