Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMA5O15230 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms