Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms