Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms