Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A3GALT2U3KPV4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms