Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms