Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms