Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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