Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms